![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
anillarionov6 февраля 2020 г. исследователи Ботао Сяо из Объединенной международной исследовательской лаборатории синтетической биологии и медицины Южно-Китайского технологического университета в Гуанчжоу и Лэй Сяо из Уханьского университета науки и технологии опубликовали статью о возможном происхождении нового коронавируса.
На следующий день статья была снята с веб-сайта.
Статья не понравилась многим как в КНР, так и в ВОЗ, а также на CNN, BBC, в Нью-Йорк Таймс.
Досье Пяти глаз комментирует статью следующим образом:
Исследователи из Южно-Китайского технологического университета 6 февраля опубликовали статью, в которой сделали вывод, что «коронавирус-убийца, вероятно, произошел из лаборатории в Ухане. Возможно, потребуется усилить уровень безопасности в биологических лабораториях высокого риска». «Статья была вскоре отозвана, поскольку она ‘не была подтверждена прямыми доказательствами’, по словам автора Ботао Сяо», – отмечает досье, напоминая при этом: «Ни один ученый не подтвердил, но и не опроверг выводы статьи, – заметил 5 марта ученый Янчжун Хуан». The Sunday Telegraph не утверждает, что исследование Южно-Китайского технологического университета заслуживает доверия только на основании того, что оно было включено в правительственное досье, подготовленное в рамках дела против Китая.
Ниже следуют перевод на русский язык запрещенной статьи Ботао Сяо и Лэй Сяо и ее англоязычный оригинал.
Возможное происхождение коронавируса 2019-nCoV
Препринт · Февраль 2020
DOI: 10.13140 / RG.2.2.21799.29601
2 автора, в том числе:
Ботао Сяо, Южно-Китайский технологический университет, 26 публикаций, 265 цитирований
Авторы этой публикации работают также над следующими смежными проектами:
Национальный фонд естественных наук Китая (11372116) Посмотреть проект
Национальный фонд естественных наук Китая (11772133) Посмотреть проект
Все материалы, размещенные на этой странице, были загружены Ботао Сяо 06 февраля 2020 г.
Возможное происхождение коронавируса 2019-nCoV
Ботао Сяо (1, 2*) и Лэй Сяо (3)
1 Объединенная международная исследовательская лаборатория синтетической биологии и медицины, Школа биологии и биологической инженерии, Южно-Китайский технологический университет, Гуанчжоу 510006, Китай
2 Школа физики, Университет науки и технологии Хуажонг, Ухань 430074, Китай
3 Больница Тянь Ю, Уханьский университет науки и технологии, Ухань 430064, Китай
* Автор-корреспондент: xiaob@scut.edu.cn
Тел / факс: 86-20-3938-0631
К 6 февраля 2020 года коронавирус 2019-nCoV вызвал эпидемию в Китае численностью в 28060 лабораторно подтвержденных инфекций у человека, в том числе 564 смертельных случая. Два описания вируса, опубликованные в Nature на этой неделе, показали, что последовательности генома от пациентов идентичны на 96% или 89% коронавирусу Bat CoV ZC45, первоначально обнаруженному у Rhinolophus affinis (1,2). Крайне важно изучить, откуда появился этот возбудитель, и каким образом он передался человеку.
В статье, опубликованной в The Lancet, сообщалось, что у 41 пациента из Уханя был обнаружен острый респираторный синдром, причем у 27 из них был контакт с рынком морепродуктов Хуанань (3). Вирус 2019-nCoV был обнаружен в 33 из 585 проб, собранных на рынке после вспышки. Рынок стали подозревать в том, что он стал источником эпидемии, и потому он был закрыт в соответствии с карантинными правилами по отношению к источнику во время эпидемии.
Летучие мыши, являющиеся носителями CoV ZC45, были первоначально найдены в провинциях Юньнань или Чжэцзян, каждая из которых находится более чем в 900 километрах от рынка морепродуктов. Обычно летучие мыши живут в пещерах и на деревьях. Но рынок морепродуктов находится в густонаселенном районе Уханя, где проживает около 15 миллионов человек. Вероятность того, что летучие мыши прилетели на рынок, является очень низкой. Согласно муниципальным отчетам и свидетельствам 31 жителя и 28 посетителей рынка, летучие мыши никогда не были источником питания в городе, и на рынке не продавалось ни одной летучей мыши. Естественная рекомбинация или же наличие промежуточного хозяина коронавируса возможны, но для этого пока мало доказательств.
Был ли другой возможный путь? Мы обследовали территорию вокруг рынка морепродуктов и определили две лаборатории, проводящие исследования над коронавирусами летучих мышей. Примерно в 280 метрах от рынка находится Уханьский центр по контролю и профилактике заболеваний (WHCDC) (рис. 1, карты Baidu и Google). WHCDC размещал животных в лабораториях для исследовательских целей, одна из которых специализировалась на сборе и идентификации патогенов (4-6). Для одного из этих исследований 155 летучих мышей, включая Rhinolophus affinis, были отловлены в провинции Хубэй, а другие 450 летучих мышей были выловлены в провинции Чжэцзян (4). Эксперт по отлову мышей отмечен в разделе Авторы (JHT). Кроме того, он выступал в медиа по вопросу о коллекционировании вирусов в общенациональных газетах и на сайтах в 2017 и 2019 годах (7, 8). Он рассказал, что однажды на него напали летучие мыши, и кровь летучей мыши попала ему на кожу. Он знал о чрезвычайной опасности заражения, поэтому он поместил себя в карантин на 14 дней (7). В результате другого инцидента он снова изолировал себя, потому что летучие мыши помочились на него. Однажды он был в полном восторге от того, что смог поймать летучую мышь с живым клещом (8).
На пойманных животных проводились хирургические операции, а образцы их тканей собирались для выделения их ДНК и РНК и секвенирования (4, 5). Образцы тканей и инфицированные отходы являлись источниками патогенов. Они оказались всего примерно в 280 метрах от рынка морепродуктов. WHCDC также находится рядом с Объединенным госпиталем (рис. 1, внизу), где во время этой эпидемии была заражена первая группа врачей. Вполне вероятно, что вирус просочился, и некоторые из врачей заразили первых пациентов этой эпидемии, хотя для будущего исследования необходимы веские доказательства.
Вторая лаборатория находится примерно в 12 км от рынка морепродуктов и принадлежит Уханьскому институту вирусологии Академии наук Китая (1, 9, 10). Эта лаборатория сообщила, что китайские подковоносые летучие мыши являются естественным резервуаром для коронавируса SARS-CoV, вызывающего тяжелый острый респираторный синдром, приведшего к пандемии 2002-2003 гг. (9). Главный исследователь этой лаборатории участвовала в проекте, в котором с помощью обратного генетического подхода к SARS-CoV сгенерировала химерный вирус и сообщила о возможности передачи его человеку (10). [Наше] прямое предположение заключается в том, что вирус SARS-CoV или его производный мог выскочить из лаборатории.
Таким образом, кто-то замешан в истории с эволюцией коронавируса 2019-nCoV. В дополнение к версии о происхождении вируса путем естественной рекомбинации с помощью промежуточного хозяина, имеется версия, согласно которой коронавирус-убийца, вероятно, произошел из лаборатории в Ухане. Очевидно, в лабораториях с высокой степенью риска потребуется повысить уровень безопасности. Возможно, необходимо будет принять правило по перемещению этих лабораторий подальше от городских центров и других густонаселенных мест.
Авторы
BС разработал план статьи и собрал литературу. Все авторы провели сбор и анализ данных, собрали документы, нарисовали карту и участвовали в написании статьи.
Признание
Эта работа поддерживается Национальным фондом естественных наук Китая (11772133, 11372116).
Декларация интересов
Все авторы заявляют об отсутствии конкурирующих интересов.
Ссылки
1. Zhou P, Yang X-L, Wang X-G et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7.
2. Wu F, Zhao S, Yu B, et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2008-3.
3. Huang C, Wang Y, Li X, et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. The Lancet 2019. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30183-5.
4. Guo WP, Lin XD, Wang W, et al. Phylogeny and origins of hantaviruses harbored by bats, insectivores, and rodents. PLoS pathogens 2013; 9(2): e1003159.
5. Lu M, Tian JH, Yu B, Guo WP, Holmes EC, Zhang YZ. Extensive diversity of rickettsiales bacteria in ticks from Wuhan, China. Ticks and tick-borne diseases 2017; 8(4): 574-80.
6. Shi M, Lin XD, Chen X, et al. The evolutionary history of vertebrate RNA viruses. Nature 2018; 556(7700): 197-202.
7. Tao P. Expert in Wuhan collected ten thousands animals: capture bats in mountain at night. Changjiang Times 2017.
8. Li QX, Zhanyao. Playing with elephant dung, fishing for sea bottom mud: the work that will change China's future. thepaper 2019.
9. Ge XY, Li JL, Yang XL, et al. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature 2013; 503(7477): 535-8.
10. Menachery VD, Yount BL, Jr., Debbink K, et al. A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nature medicine 2015; 21(12): 1508-13.
Рисунок 1. Рынок морепродуктов Хуанань находится недалеко от WHCDC (из карт Baidu и Google).
https://img-prod.tgcom24.mediaset.it/images/2020/02/16/114720192-5eb8307f-017c-4075-a697-348628da0204.pdf
The possible origins of 2019-nCoV coronavirus
Preprint · February 2020
DOI: 10.13140/RG.2.2.21799.29601
2 authors, including:
Botao Xiao South China University of Technology 26 PUBLICATIONS 265 CITATIONS
Some of the authors of this publication are also working on these related projects:
National Natural Science Foundation of China (11372116) View project
National Natural Science Foundation of China (11772133) View project
All content following this page was uploaded by Botao Xiao on 06 February 2020
The possible origins of 2019-nCoV coronavirus
Botao Xiao1,2* and Lei Xiao3
1 Joint International Research Laboratory of Synthetic Biology and Medicine, School of Biology and Biological Engineering, South China University of Technology, Guangzhou 510006, China
2 School of Physics, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074, China
3 Tian You Hospital, Wuhan University of Science and Technology, Wuhan 430064, China
*Corresponding author: xiaob@scut.edu.cn
Tel / Fax: 86-20-3938-0631
The 2019-nCoV coronavirus has caused an epidemic of 28,060 laboratory-confirmed infections in human including 564 deaths in China by February 6, 2020. Two descriptions of the virus published on Nature this week indicated that the genome sequences from patients were 96% or 89% identical to the Bat CoV ZC45 coronavirus originally found in Rhinolophus affinis 1,2. It was critical to study where the pathogen came from and how it passed onto human.
An article published on The Lancet reported that 41 people in Wuhan were found to have the acute respiratory syndrome and 27 of them had contact with Huanan Seafood Market 3. The 2019-nCoV was found in 33 out of 585 samples collected in the market after the outbreak. The market was suspicious to be the origin of the epidemic, and was shut down according to the rule of quarantine the source during an epidemic.
The bats carrying CoV ZC45 were originally found in Yunnan or Zhejiang province, both of which were more than 900 kilometers away from the seafood market. Bats were normally found to live in caves and trees. But the seafood market is in a densely-populated district of Wuhan, a metropolitan of ~15 million people. The probability was very low for the bats to fly to the market. According to municipal reports and the testimonies of 31 residents and 28 visitors, the bat was never a food source in the city, and no bat was traded in the market. There was possible natural recombination or intermediate host of the coronavirus, yet little proof has been reported.
Was there any other possible pathway? We screened the area around the seafood market and identified two laboratories conducting research on bat coronavirus. Within ~280 meters from the market, there was the Wuhan Center for Disease Control & Prevention (WHCDC) (Figure 1, from Baidu and Google maps). WHCDC hosted animals in laboratories for research purpose, one of which was specialized in pathogens collection and identification 4- 6. In one of their studies, 155 bats including Rhinolophus affinis were captured in Hubei province, and other 450 bats were captured in Zhejiang province 4. The expert in collection was noted in the Author Contributions (JHT). Moreover, he was broadcasted for collecting viruses on nation-wide newspapers and websites in 2017 and 2019 7,8. He described that he was once by attacked by bats and the blood of a bat shot on his skin. He knew the extreme danger of the infection so he quarantined himself for 14 days 7. In another accident, he quarantined himself again because bats peed on him. He was once thrilled for capturing a bat carrying a live tick 8.
Surgery was performed on the caged animals and the tissue samples were collected for DNA and RNA extraction and sequencing 4, 5. The tissue samples and contaminated trashes were source of pathogens. They were only ~280 meters from the seafood market. The WHCDC was also adjacent to the Union Hospital (Figure 1, bottom) where the first group of doctors were infected during this epidemic. It is plausible that the virus leaked around and some of them contaminated the initial patients in this epidemic, though solid proofs are needed in future study.
The second laboratory was ~12 kilometers from the seafood market and belonged to Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences 1, 9, 10. This laboratory reported that the Chinese horseshoe bats were natural reservoirs for the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) which caused the 2002-3 pandemic 9. The principle investigator participated in a project which generated a chimeric virus using the SARS-CoV reverse genetics system, and reported the potential for human emergence 10. A direct speculation was that SARS-CoV or its derivative might leak from the laboratory.
In summary, somebody was entangled with the evolution of 2019-nCoV coronavirus. In addition to origins of natural recombination and intermediate host, the killer coronavirus probably originated from a laboratory in Wuhan. Safety level may need to be reinforced in high risk biohazardous laboratories. Regulations may be taken to relocate these laboratories far away from city center and other densely populated places.
Contributors
BX designed the comment and performed literature search. All authors performed data acquisition and analysis, collected documents, draw the figure, and wrote the papers.
Acknowledgements
This work is supported by the National Natural Science Foundation of China (11772133, 11372116).
Declaration of interests
All authors declare no competing interests.
References
1. Zhou P, Yang X-L, Wang X-G, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7.
2. Wu F, Zhao S, Yu B, et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2008-3.
3. Huang C, Wang Y, Li X, et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. The Lancet 2019. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30183-5.
4. Guo WP, Lin XD, Wang W, et al. Phylogeny and origins of hantaviruses harbored by bats, insectivores, and rodents. PLoS pathogens 2013; 9(2): e1003159.
5. Lu M, Tian JH, Yu B, Guo WP, Holmes EC, Zhang YZ. Extensive diversity of rickettsiales bacteria in ticks from Wuhan, China. Ticks and tick-borne diseases 2017; 8(4): 574-80.
6. Shi M, Lin XD, Chen X, et al. The evolutionary history of vertebrate RNA viruses. Nature 2018; 556(7700): 197-202.
7. Tao P. Expert in Wuhan collected ten thousands animals: capture bats in mountain at night. Changjiang Times 2017.
8. Li QX, Zhanyao. Playing with elephant dung, fishing for sea bottom mud: the work that will change China's future. thepaper 2019.
9. Ge XY, Li JL, Yang XL, et al. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature 2013; 503(7477): 535-8.
10. Menachery VD, Yount BL, Jr., Debbink K, et al. A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nature medicine 2015; 21(12): 1508-13.
Figure 1. The Huanan Seafood Market is close to the WHCDC (from Baidu and Google maps).
https://img-prod.tgcom24.mediaset.it/images/2020/02/16/114720192-5eb8307f-017c-4075-a697-348628da0204.pdf
На следующий день статья была снята с веб-сайта.
Статья не понравилась многим как в КНР, так и в ВОЗ, а также на CNN, BBC, в Нью-Йорк Таймс.
Досье Пяти глаз комментирует статью следующим образом:
Исследователи из Южно-Китайского технологического университета 6 февраля опубликовали статью, в которой сделали вывод, что «коронавирус-убийца, вероятно, произошел из лаборатории в Ухане. Возможно, потребуется усилить уровень безопасности в биологических лабораториях высокого риска». «Статья была вскоре отозвана, поскольку она ‘не была подтверждена прямыми доказательствами’, по словам автора Ботао Сяо», – отмечает досье, напоминая при этом: «Ни один ученый не подтвердил, но и не опроверг выводы статьи, – заметил 5 марта ученый Янчжун Хуан». The Sunday Telegraph не утверждает, что исследование Южно-Китайского технологического университета заслуживает доверия только на основании того, что оно было включено в правительственное досье, подготовленное в рамках дела против Китая.
Ниже следуют перевод на русский язык запрещенной статьи Ботао Сяо и Лэй Сяо и ее англоязычный оригинал.
Возможное происхождение коронавируса 2019-nCoV
Препринт · Февраль 2020
DOI: 10.13140 / RG.2.2.21799.29601
2 автора, в том числе:
Ботао Сяо, Южно-Китайский технологический университет, 26 публикаций, 265 цитирований
Авторы этой публикации работают также над следующими смежными проектами:
Национальный фонд естественных наук Китая (11372116) Посмотреть проект
Национальный фонд естественных наук Китая (11772133) Посмотреть проект
Все материалы, размещенные на этой странице, были загружены Ботао Сяо 06 февраля 2020 г.
Возможное происхождение коронавируса 2019-nCoV
Ботао Сяо (1, 2*) и Лэй Сяо (3)
1 Объединенная международная исследовательская лаборатория синтетической биологии и медицины, Школа биологии и биологической инженерии, Южно-Китайский технологический университет, Гуанчжоу 510006, Китай
2 Школа физики, Университет науки и технологии Хуажонг, Ухань 430074, Китай
3 Больница Тянь Ю, Уханьский университет науки и технологии, Ухань 430064, Китай
* Автор-корреспондент: xiaob@scut.edu.cn
Тел / факс: 86-20-3938-0631
К 6 февраля 2020 года коронавирус 2019-nCoV вызвал эпидемию в Китае численностью в 28060 лабораторно подтвержденных инфекций у человека, в том числе 564 смертельных случая. Два описания вируса, опубликованные в Nature на этой неделе, показали, что последовательности генома от пациентов идентичны на 96% или 89% коронавирусу Bat CoV ZC45, первоначально обнаруженному у Rhinolophus affinis (1,2). Крайне важно изучить, откуда появился этот возбудитель, и каким образом он передался человеку.
В статье, опубликованной в The Lancet, сообщалось, что у 41 пациента из Уханя был обнаружен острый респираторный синдром, причем у 27 из них был контакт с рынком морепродуктов Хуанань (3). Вирус 2019-nCoV был обнаружен в 33 из 585 проб, собранных на рынке после вспышки. Рынок стали подозревать в том, что он стал источником эпидемии, и потому он был закрыт в соответствии с карантинными правилами по отношению к источнику во время эпидемии.
Летучие мыши, являющиеся носителями CoV ZC45, были первоначально найдены в провинциях Юньнань или Чжэцзян, каждая из которых находится более чем в 900 километрах от рынка морепродуктов. Обычно летучие мыши живут в пещерах и на деревьях. Но рынок морепродуктов находится в густонаселенном районе Уханя, где проживает около 15 миллионов человек. Вероятность того, что летучие мыши прилетели на рынок, является очень низкой. Согласно муниципальным отчетам и свидетельствам 31 жителя и 28 посетителей рынка, летучие мыши никогда не были источником питания в городе, и на рынке не продавалось ни одной летучей мыши. Естественная рекомбинация или же наличие промежуточного хозяина коронавируса возможны, но для этого пока мало доказательств.
Был ли другой возможный путь? Мы обследовали территорию вокруг рынка морепродуктов и определили две лаборатории, проводящие исследования над коронавирусами летучих мышей. Примерно в 280 метрах от рынка находится Уханьский центр по контролю и профилактике заболеваний (WHCDC) (рис. 1, карты Baidu и Google). WHCDC размещал животных в лабораториях для исследовательских целей, одна из которых специализировалась на сборе и идентификации патогенов (4-6). Для одного из этих исследований 155 летучих мышей, включая Rhinolophus affinis, были отловлены в провинции Хубэй, а другие 450 летучих мышей были выловлены в провинции Чжэцзян (4). Эксперт по отлову мышей отмечен в разделе Авторы (JHT). Кроме того, он выступал в медиа по вопросу о коллекционировании вирусов в общенациональных газетах и на сайтах в 2017 и 2019 годах (7, 8). Он рассказал, что однажды на него напали летучие мыши, и кровь летучей мыши попала ему на кожу. Он знал о чрезвычайной опасности заражения, поэтому он поместил себя в карантин на 14 дней (7). В результате другого инцидента он снова изолировал себя, потому что летучие мыши помочились на него. Однажды он был в полном восторге от того, что смог поймать летучую мышь с живым клещом (8).
На пойманных животных проводились хирургические операции, а образцы их тканей собирались для выделения их ДНК и РНК и секвенирования (4, 5). Образцы тканей и инфицированные отходы являлись источниками патогенов. Они оказались всего примерно в 280 метрах от рынка морепродуктов. WHCDC также находится рядом с Объединенным госпиталем (рис. 1, внизу), где во время этой эпидемии была заражена первая группа врачей. Вполне вероятно, что вирус просочился, и некоторые из врачей заразили первых пациентов этой эпидемии, хотя для будущего исследования необходимы веские доказательства.
Вторая лаборатория находится примерно в 12 км от рынка морепродуктов и принадлежит Уханьскому институту вирусологии Академии наук Китая (1, 9, 10). Эта лаборатория сообщила, что китайские подковоносые летучие мыши являются естественным резервуаром для коронавируса SARS-CoV, вызывающего тяжелый острый респираторный синдром, приведшего к пандемии 2002-2003 гг. (9). Главный исследователь этой лаборатории участвовала в проекте, в котором с помощью обратного генетического подхода к SARS-CoV сгенерировала химерный вирус и сообщила о возможности передачи его человеку (10). [Наше] прямое предположение заключается в том, что вирус SARS-CoV или его производный мог выскочить из лаборатории.
Таким образом, кто-то замешан в истории с эволюцией коронавируса 2019-nCoV. В дополнение к версии о происхождении вируса путем естественной рекомбинации с помощью промежуточного хозяина, имеется версия, согласно которой коронавирус-убийца, вероятно, произошел из лаборатории в Ухане. Очевидно, в лабораториях с высокой степенью риска потребуется повысить уровень безопасности. Возможно, необходимо будет принять правило по перемещению этих лабораторий подальше от городских центров и других густонаселенных мест.
Авторы
BС разработал план статьи и собрал литературу. Все авторы провели сбор и анализ данных, собрали документы, нарисовали карту и участвовали в написании статьи.
Признание
Эта работа поддерживается Национальным фондом естественных наук Китая (11772133, 11372116).
Декларация интересов
Все авторы заявляют об отсутствии конкурирующих интересов.
Ссылки
1. Zhou P, Yang X-L, Wang X-G et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7.
2. Wu F, Zhao S, Yu B, et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2008-3.
3. Huang C, Wang Y, Li X, et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. The Lancet 2019. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30183-5.
4. Guo WP, Lin XD, Wang W, et al. Phylogeny and origins of hantaviruses harbored by bats, insectivores, and rodents. PLoS pathogens 2013; 9(2): e1003159.
5. Lu M, Tian JH, Yu B, Guo WP, Holmes EC, Zhang YZ. Extensive diversity of rickettsiales bacteria in ticks from Wuhan, China. Ticks and tick-borne diseases 2017; 8(4): 574-80.
6. Shi M, Lin XD, Chen X, et al. The evolutionary history of vertebrate RNA viruses. Nature 2018; 556(7700): 197-202.
7. Tao P. Expert in Wuhan collected ten thousands animals: capture bats in mountain at night. Changjiang Times 2017.
8. Li QX, Zhanyao. Playing with elephant dung, fishing for sea bottom mud: the work that will change China's future. thepaper 2019.
9. Ge XY, Li JL, Yang XL, et al. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature 2013; 503(7477): 535-8.
10. Menachery VD, Yount BL, Jr., Debbink K, et al. A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nature medicine 2015; 21(12): 1508-13.
Рисунок 1. Рынок морепродуктов Хуанань находится недалеко от WHCDC (из карт Baidu и Google).
https://img-prod.tgcom24.mediaset.it/images/2020/02/16/114720192-5eb8307f-017c-4075-a697-348628da0204.pdf
The possible origins of 2019-nCoV coronavirus
Preprint · February 2020
DOI: 10.13140/RG.2.2.21799.29601
2 authors, including:
Botao Xiao South China University of Technology 26 PUBLICATIONS 265 CITATIONS
Some of the authors of this publication are also working on these related projects:
National Natural Science Foundation of China (11372116) View project
National Natural Science Foundation of China (11772133) View project
All content following this page was uploaded by Botao Xiao on 06 February 2020
The possible origins of 2019-nCoV coronavirus
Botao Xiao1,2* and Lei Xiao3
1 Joint International Research Laboratory of Synthetic Biology and Medicine, School of Biology and Biological Engineering, South China University of Technology, Guangzhou 510006, China
2 School of Physics, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074, China
3 Tian You Hospital, Wuhan University of Science and Technology, Wuhan 430064, China
*Corresponding author: xiaob@scut.edu.cn
Tel / Fax: 86-20-3938-0631
The 2019-nCoV coronavirus has caused an epidemic of 28,060 laboratory-confirmed infections in human including 564 deaths in China by February 6, 2020. Two descriptions of the virus published on Nature this week indicated that the genome sequences from patients were 96% or 89% identical to the Bat CoV ZC45 coronavirus originally found in Rhinolophus affinis 1,2. It was critical to study where the pathogen came from and how it passed onto human.
An article published on The Lancet reported that 41 people in Wuhan were found to have the acute respiratory syndrome and 27 of them had contact with Huanan Seafood Market 3. The 2019-nCoV was found in 33 out of 585 samples collected in the market after the outbreak. The market was suspicious to be the origin of the epidemic, and was shut down according to the rule of quarantine the source during an epidemic.
The bats carrying CoV ZC45 were originally found in Yunnan or Zhejiang province, both of which were more than 900 kilometers away from the seafood market. Bats were normally found to live in caves and trees. But the seafood market is in a densely-populated district of Wuhan, a metropolitan of ~15 million people. The probability was very low for the bats to fly to the market. According to municipal reports and the testimonies of 31 residents and 28 visitors, the bat was never a food source in the city, and no bat was traded in the market. There was possible natural recombination or intermediate host of the coronavirus, yet little proof has been reported.
Was there any other possible pathway? We screened the area around the seafood market and identified two laboratories conducting research on bat coronavirus. Within ~280 meters from the market, there was the Wuhan Center for Disease Control & Prevention (WHCDC) (Figure 1, from Baidu and Google maps). WHCDC hosted animals in laboratories for research purpose, one of which was specialized in pathogens collection and identification 4- 6. In one of their studies, 155 bats including Rhinolophus affinis were captured in Hubei province, and other 450 bats were captured in Zhejiang province 4. The expert in collection was noted in the Author Contributions (JHT). Moreover, he was broadcasted for collecting viruses on nation-wide newspapers and websites in 2017 and 2019 7,8. He described that he was once by attacked by bats and the blood of a bat shot on his skin. He knew the extreme danger of the infection so he quarantined himself for 14 days 7. In another accident, he quarantined himself again because bats peed on him. He was once thrilled for capturing a bat carrying a live tick 8.
Surgery was performed on the caged animals and the tissue samples were collected for DNA and RNA extraction and sequencing 4, 5. The tissue samples and contaminated trashes were source of pathogens. They were only ~280 meters from the seafood market. The WHCDC was also adjacent to the Union Hospital (Figure 1, bottom) where the first group of doctors were infected during this epidemic. It is plausible that the virus leaked around and some of them contaminated the initial patients in this epidemic, though solid proofs are needed in future study.
The second laboratory was ~12 kilometers from the seafood market and belonged to Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences 1, 9, 10. This laboratory reported that the Chinese horseshoe bats were natural reservoirs for the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) which caused the 2002-3 pandemic 9. The principle investigator participated in a project which generated a chimeric virus using the SARS-CoV reverse genetics system, and reported the potential for human emergence 10. A direct speculation was that SARS-CoV or its derivative might leak from the laboratory.
In summary, somebody was entangled with the evolution of 2019-nCoV coronavirus. In addition to origins of natural recombination and intermediate host, the killer coronavirus probably originated from a laboratory in Wuhan. Safety level may need to be reinforced in high risk biohazardous laboratories. Regulations may be taken to relocate these laboratories far away from city center and other densely populated places.
Contributors
BX designed the comment and performed literature search. All authors performed data acquisition and analysis, collected documents, draw the figure, and wrote the papers.
Acknowledgements
This work is supported by the National Natural Science Foundation of China (11772133, 11372116).
Declaration of interests
All authors declare no competing interests.
References
1. Zhou P, Yang X-L, Wang X-G, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7.
2. Wu F, Zhao S, Yu B, et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2008-3.
3. Huang C, Wang Y, Li X, et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. The Lancet 2019. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30183-5.
4. Guo WP, Lin XD, Wang W, et al. Phylogeny and origins of hantaviruses harbored by bats, insectivores, and rodents. PLoS pathogens 2013; 9(2): e1003159.
5. Lu M, Tian JH, Yu B, Guo WP, Holmes EC, Zhang YZ. Extensive diversity of rickettsiales bacteria in ticks from Wuhan, China. Ticks and tick-borne diseases 2017; 8(4): 574-80.
6. Shi M, Lin XD, Chen X, et al. The evolutionary history of vertebrate RNA viruses. Nature 2018; 556(7700): 197-202.
7. Tao P. Expert in Wuhan collected ten thousands animals: capture bats in mountain at night. Changjiang Times 2017.
8. Li QX, Zhanyao. Playing with elephant dung, fishing for sea bottom mud: the work that will change China's future. thepaper 2019.
9. Ge XY, Li JL, Yang XL, et al. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature 2013; 503(7477): 535-8.
10. Menachery VD, Yount BL, Jr., Debbink K, et al. A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nature medicine 2015; 21(12): 1508-13.
Figure 1. The Huanan Seafood Market is close to the WHCDC (from Baidu and Google maps).
https://img-prod.tgcom24.mediaset.it/images/2020/02/16/114720192-5eb8307f-017c-4075-a697-348628da0204.pdf
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2020-05-07 11:38 am (UTC)no subject
Date: 2020-05-07 12:37 pm (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 05:17 pm (UTC) - Expandno subject
Date: 2020-05-07 12:38 pm (UTC)no subject
Date: 2020-05-07 12:48 pm (UTC)И сегодня пролетела новость об убийстве китайского учёного в США
no subject
Date: 2020-05-07 09:54 pm (UTC)(no subject)
From:Nerd Has Power?
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 07:42 am (UTC) - Expandno subject
Date: 2020-05-07 01:46 pm (UTC)no subject
Date: 2020-05-09 05:27 pm (UTC)no subject
Date: 2020-05-07 03:31 pm (UTC)если даже "испарения" быть опасны и приводить к заражениям, то реальный вариант развития событий
no subject
Date: 2020-05-07 06:53 pm (UTC)Потом почему то и зачем стали умалчивать эту информацию .
Я люблю всегда прислушиваться к первым новостным подробностям . Они важны .и часто их изменяют или просто не говорят больше о них .
Помню первые новости о лодке Курск . а потом были совсем другие версии . Но первые озвучки были интересными ..
опасности попадания вируса в канализацию
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 07:40 am (UTC) - ExpandRe: опасности попадания вируса в канализацию
From:Re: опасности попадания вируса в канализацию
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 09:45 am (UTC) - ExpandRe: опасности попадания вируса в канализацию
From:Re: опасности попадания вируса в канализацию
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 06:50 pm (UTC) - Expand(no subject)
From:no subject
Date: 2020-05-07 03:34 pm (UTC)https://hightech.fm/2020/05/06/doctor-death-coronavirus
no subject
Date: 2020-05-07 09:58 pm (UTC)Здесь присутствует и второй фактор - низкий уровень защищённости ввиду недостаточности СИЗ.
(no subject)
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 05:31 am (UTC) - Expand(no subject)
From:(no subject)
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 11:15 am (UTC) - Expandno subject
Date: 2020-05-07 03:39 pm (UTC)no subject
Date: 2020-05-07 10:23 pm (UTC)no subject
Date: 2020-05-07 03:45 pm (UTC)no subject
Date: 2020-05-07 09:14 pm (UTC)доверие "ученому сообществу"
Date: 2020-05-07 04:53 pm (UTC)Пример Монтанье (нобелевский лауреат, вирусология) заявляет о синтетическом происхождении вируса (в категоричной форме).
"Если вы хотите, чтобы в геноме коронавируса возникла бы последовательность вируса иммунодефицита, нужно обладать соответствующими инструментами на молекулярном уровне, это не может произойти естественно. Сам пациент, инфицированный СПИДом, этого сделать не может. В этом должен участвовать сотрудник лаборатории. Раньше для этого требовалась очень высокая квалификация, подобная манипуляция была по плечу очень немногим. Но уже несколько лет, как этот процесс очень упростился."
Пример Вирусолог и специалист по эволюции геномов Кунин опровергает версию об искусственном происхождении нового коронавируса SARS-CoV-2 (в категоричной форме).
"Исследования генома ясно показывают, что никто искусственно эти вирусы не создавал. Любые подобные утверждения — это патологический бред. Мы можем встроить SARS-CoV-2 в генетическое дерево других коронавирусов, они эволюционировали совершенно нормально. Любое утверждение об обратном свидетельствует либо о недобросовестности, либо о безграмотности и патологическом интересе к конспирологии."
Один из них либо прямо лжет, либо сильно заблуждается. Проверяется ли это в условиях лаборатории? Конечно проверяется. Сделано ли это??? Пока нет. Почему?
Чисто умозрительно совпадения на duck-test.
-Институт вирусологии в Ухани, начало эпидемии в Ухани.
-Институт вирусологии изучал именно этот вирус, именно этот вирус и вызывает эпидемию.
-Задолго до эпидемии были статьи о недостаточных мерах безопасности в лабораториях Ухани.
-Действия правительства КНР выглядят именно как сокрытие возможной утечки вируса из лаборатории.
- Странный вирус - и сходство с панголиновыми вирусами, и последовательность вируса иммунодефицита, и работы Ши Чжэньли в которых слишком большое совпадение с с тем что вызывает эпидемию...
Если что-то выглядит как утка, плавает как утка и крякает как утка, это, вероятно, и есть утка.
Можно ли сказать что "наука на службе бизнеса и политики"? Если исследования должны финансироватся, то наверно да. Если такого исследования нет, значит оно пока никому не выгодно.
Re: доверие "ученому сообществу"
Date: 2020-05-08 08:47 am (UTC)Сообщество пытается дискредитировать наиболее очевидную и логичную версию про лабораторию,
подменяя её обтекаемой и недоказуемой версией про рынок.
Re: доверие "ученому сообществу"
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2020-05-07 05:00 pm (UTC)no subject
Date: 2020-05-07 05:45 pm (UTC)https://www.nakanune.ru/news/2020/5/7/22572927/
В США профессор Питтсбурского университета, гражданин КНР Бинг Лю был найден застреленным в собственном доме. По данным CNN, ученый занимался исследованием COVID-19.
Полиция сообщила, что тело мужчины с многочисленными огнестрельными ранениями в голову, шею, туловище и конечности было обнаружено в таунхаусе.
Позже недалеко от места происшествия в автомобиле был найден мертвым еще один мужчина. Следствие предполагает, что второй убитый застрелил Лю, потом сел в машину и, предположительно, выстрелил в себя. Также в правоохранительных органах считают, что погибшие были знакомы, но "нет никаких признаков того, что убийство произошло из-за национальности профессора".
Университет опубликовал заявление, в котором говорится, что сообщество "глубоко опечалено трагической смертью Бинг Лю, талантливого исследователя и коллеги, которым все восхищались". "Бинг был на пороге важных открытий в понимании механизмов, лежащих в основе вируса SARS-CoV-2", - отметили в университете.
no subject
Date: 2020-05-07 08:37 pm (UTC)Очевидно, КПК.
Investigators believe an unidentified second man, who was found dead in his car, shot and killed Liu in his home before returning to his car and taking his own life.
Police believe the men knew each other, but say there is "zero indication that there was targeting due to his (Liu) being Chinese," according to Detective Sgt. Brian Kohlhepp.
https://edition.cnn.com/2020/05/06/us/university-of-pittsburgh-professor-killed/index.html
(no subject)
From:former unbanned_f_b
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-07 11:12 pm (UTC) - ExpandRe: former unbanned_f_b
From:former unbanned_f_b
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-07 11:16 pm (UTC) - Expand(no subject)
From:no subject
Date: 2020-05-07 05:56 pm (UTC)no subject
Date: 2020-05-09 05:55 pm (UTC)Возможное ?
Date: 2020-05-07 06:13 pm (UTC)Вы много раз доказывали, что блестяще владеете математическим аппаратом (это не комплимент, а сухая констатация факта; по крайней мере с этой точки зрения я могу оценить вашу деятельность профессионально). Вы наверняка знаете, что в математике есть способ доказательства теоремы от обратного (противного).
Для читателей поясню на пальцах. Дано: теорема - если А=С и В=С, то А=В. Доказательство от обратного: допутим А=/=В (не равно). Тогда в силу математических законов либо А=/=С, либо В=/=С, что противоречит условию теоремы. Таким образом, теорема доказана.
Так вот ваш текст "конспирологическая версия" - это именно доказательство искусственного происхождения вируса от обратного. Вы предположили, что вирус произошел естественным образом и попытались найти способ как это могло случится. И объективно показали, что это совершенно невозможно. Таким образом, вы фактически доказали невозможность естественного происхождения вируса, что автоматически доказывет его искусственное происхождение.
Таким образом, слово "возможное" можно интерпретировать только одним способом. Не тем, что вирус возник естественно (это уже опровергнуто). А тем, что вирус мог быть создан в другой лаборатории, но в любом случае в какой-то лаборатории, и принесен в окрестность уханьской лаборатории. Возможен ли такой вариант ? Теоретически - да. Практически - кранйе маловероятно.
Этоэтому я и считаю слово "возможное" вредным.
Спасибо, Сергей!
Date: 2020-05-07 06:20 pm (UTC)"The possible origins of 2019-nCoV coronavirus".
Другой вопрос - нужно ли поставить это название в кавычки?
Re: Спасибо, Сергей!
From:Re: в порядке этой дискусии
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-07 08:46 pm (UTC) - Expand(no subject)
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-07 09:49 pm (UTC) - ExpandRe: в порядке этой дискусии
From:Re: в порядке этой дискусии
From:Re: в порядке этой дискусии
From:Re: в порядке этой дискусии
From:(no subject)
From:The Mother of The Devil
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 02:06 pm (UTC) - ExpandRe: The Mother of The Devil
From:Re: в порядке этой дискусии
From:Re: в порядке этой дискусии
From:Re: в порядке этой дискусии
From:no subject
Date: 2020-05-07 06:31 pm (UTC)оффтоп
Date: 2020-05-07 08:05 pm (UTC)Это рекламировал профессор Сонин.
Гиперинфляция 92го - прекрасная вещь!! Ни Гайдар ни Геращенко ни в чем не виноваты.
А еще раньше профессор Сонин сказал что гиперинфляцию остановили слишком рано и резко, экономике нужны были деньги.
Может быть
Date: 2020-05-07 08:33 pm (UTC)no subject
Date: 2020-05-07 08:51 pm (UTC)Появление фуринового сайта представляется очень необычным...
Там еще комментарии можно целый день читать))
https://shvarz.livejournal.com/452297.html
no subject
Date: 2020-05-08 06:39 am (UTC)Re: вполне разумная рецензия
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 11:56 am (UTC) - ExpandВирус
Date: 2020-05-07 09:13 pm (UTC)Разрабатываем в лаборатории, приносим на рынок и выпускаем. И все.
Читайте Бусидо.
Re: Вирус
Date: 2020-05-07 10:07 pm (UTC)Может, никто вовсе не отправлял целенаправленно вирус на рынок, а его туда доставили вездесущие крысы?
Случайно, добровольно и безвозмездно ...
Re: Вирус
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 01:27 pm (UTC) - ExpandRe: Вирус
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 02:09 pm (UTC) - Expand(no subject)
From:no subject
Date: 2020-05-07 09:36 pm (UTC)При уханьском институте вирусологии действуют две лаборатории:
- лаборатория P4 (для «возбудителя 4 класса» - самый опасный) - это учреждение с очень высоким уровнем безопасности, в котором могут храниться штаммы известных вирусов, таких как Эбола.. Около тридцати лабораторий P4 существуют в мире. В Ухане P4 открыли в 2018 году, при содействии Франции..
- с 2012 года в институте также есть лаборатория P3, которая обычно изучает менее опасные вирусы, такие как коронавирусы...
https://www.sciencesetavenir.fr/sante/covid-19-que-sait-on-du-laboratoire-chinois-pointe-du-doigt-par-les-etats-unis_144125
no subject
Date: 2020-05-07 11:23 pm (UTC)на более ранний срок и сразу в нескольких местах .
ждёмс ...
с уважением.
На воре шапка горит
Date: 2020-05-08 12:52 am (UTC)Почему нужно запрещать какие-то версии?
Как единственно верной может считаться только одна версия, если это версия?
Как единственно верной может считаться догма, если цель науки — ставить под сомнение имеющиеся догмы?
Почему нельзя/невозможно ставить вопросы и требовать ответов от руководителей т.н.наукой к плодам их деятельности?
https://www.youtube.com/playlist?list=PLMzS_8mcnIQMD_KIA7PBpdCFF5_mcSDwE
(пожалуйста, смотрите! начните с конца, а потом непосредственно серии)
Потому что это узурпация и произвол, если не говорить больше..
Еще вчера было это свежеопубликованное видео
https://aillarionov.livejournal.com/1178178.html?thread=107123522#t107123522
“Plandemic The Movie” What you're not being told about Dr. Fauci - Dr. Judy Mikovits, PhD Interview
25:53
, которое содержало информацию с эффектом разорвавшейся бомбы (сотрудница Монтанье открытие ВИЧ, преследования и угрозы, вакцины, в том числе и недавно обсуждавшиеся здесь «от гриппа» и их связь с настоящей пандемией) .
Сегодня оно уже удалено Ютубом. Ютуб удаляет и фрагменты.
DR JUDY MIKOVITS: THE TRUTH ABOUT FAUCI https://youtu.be/YD73ie4ncbs
А подобные прогнозы уже не кажутся конспирологией, хайпом и фантастикой .. https://youtu.be/TqOrUT61qmI
…...........
КУДА идем.... ?!
Re: На воре шапка горит
Date: 2020-05-08 08:45 am (UTC)(no subject)
From:В частичную, скорее.
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-10 06:59 am (UTC) - Expandno subject
Date: 2020-05-08 06:00 am (UTC)Смотрите, Ши с ее лабораторией примерно 15 лет шли к триумфу - доказательству возможности сборки из природных компонентов опасного для человека вируса. Это громкие статьи в Nature, "респект и уважуха" в научных кругах и т.п.
Причем работа уже по сути, готова. Наверняка уже пишутся статьи, идет поиск коллаборации для подтверждения результатов (ну хотя бы у соседей - эпидемиологов), им передаются образцы, и тут на тебе - начинается эпидемия. Причем тем кто в теме, все сразу понятно: утечка по халатности или "из мести недооценившему начальству". Причем это могло быть не только из самой лаборатории Ши, но и у коллаборантов.
То есть, вместо "респекта и уважухи" на научной карьере можно ставить крест.
И слова Ши о "нецивилизованных привычках" - есть не что иное, как прямое признание именно этого факта. Что кто-то их всех "подставил".
А все остальное - уже неуклюжие попытки игр китайских чиновников всех рангов, типичное поведение тоталитарной бюрократии.
С уважением, Сергей.
no subject
Date: 2020-05-08 07:14 am (UTC)С этим надо что-то делать.
no subject
Date: 2020-05-08 10:21 am (UTC)(no subject)
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 12:21 pm (UTC) - Expand(no subject)
From:no subject
Date: 2020-05-08 08:21 am (UTC)no subject
Date: 2020-05-08 10:07 am (UTC)(no subject)
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-10 08:44 pm (UTC) - Expand(no subject)
From:(no subject)
From:Происхождение коронавируса Ковид-19
Date: 2020-05-08 09:21 am (UTC)no subject
Date: 2020-05-08 11:58 am (UTC)Re: Происхождение коронавируса Ковид-19
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 01:03 pm (UTC) - ExpandRe: Происхождение коронавируса Ковид-19
From:Re: Происхождение коронавируса Ковид-19
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-09 10:40 am (UTC) - ExpandRe: Происхождение коронавируса Ковид-19
From: (Anonymous) - Date: 2020-05-08 06:08 pm (UTC) - Expand